MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 9692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014378	ATT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014378	TATT	2	8	53	60	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014378	ACA	2	6	68	73	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014378	TTA	2	6	86	91	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014378	T	8	8	121	128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014378	AG	3	6	155	160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014378	TAA	2	6	169	174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014378	T	6	6	205	210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014378	AT	3	6	233	238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014378	TAAAA	2	10	243	252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014378	TATT	2	8	265	272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014378	AAT	2	6	276	281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014378	CAT	3	9	296	304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014378	AGG	2	6	336	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014378	CA	3	6	1705	1710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014378	TAA	2	6	1725	1730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014378	ACTT	2	8	1795	1802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014378	AGT	2	6	1840	1845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014378	TAC	4	12	1880	1891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014378	T	6	6	1896	1901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014378	AT	3	6	1904	1909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014378	ATA	2	6	1915	1920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014378	TAA	2	6	1938	1943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014378	AGG	2	6	1953	1958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014378	AAT	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014378	AGG	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014378	TCA	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014378	T	6	6	7552	7557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014378	ATTGA	2	10	7560	7569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014378	AGG	2	6	7572	7577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014378	TTA	2	6	10022	10027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014378	A	6	6	10064	10069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014378	TAT	2	6	10077	10082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014378	AAC	2	6	10115	10120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014378	AT	3	6	10174	10179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014378	TGAT	2	8	10185	10192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014378	GAT	2	6	10226	10231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014378	AATT	2	8	10265	10272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014378	CTG	2	6	10344	10349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014378	AAT	2	6	10358	10363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014378	TCT	2	6	10372	10377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014378	AT	3	6	10402	10407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014378	TCT	2	6	10433	10438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014378	ACT	2	6	10509	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014378	GTA	2	6	10562	10567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014378	AT	3	6	10629	10634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014378	GGC	2	6	10676	10681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014378	CG	3	6	10701	10706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014378	GCT	2	6	10712	10717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014378	GCG	2	6	10736	10741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014378	TGC	2	6	10820	10825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014378	GGC	2	6	10849	10854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014378	TTG	2	6	10895	10900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014378	CGC	2	6	11044	11049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014378	GTGA	2	8	11050	11057	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014378	GAA	2	6	11093	11098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014378	TAG	2	6	11104	11109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014378	GAA	2	6	11140	11145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014378	CAG	2	6	11166	11171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014378	CAAGT	2	10	11241	11250	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014378	AAGAG	2	10	11307	11316	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014378	GAA	2	6	11358	11363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014378	CT	3	6	11382	11387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014378	TGC	2	6	11501	11506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014378	GCG	2	6	11586	11591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014378	CAG	2	6	11663	11668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014378	GGT	2	6	11698	11703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014378	GTC	2	6	11712	11717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014378	TCGTG	2	10	11721	11730	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014378	GGA	2	6	11824	11829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014378	TCA	2	6	11849	11854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014378	AC	3	6	11875	11880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014378	GCT	2	6	11905	11910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014378	GCTG	2	8	11958	11965	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014378	AC	3	6	12043	12048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014378	CAC	2	6	12058	12063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014378	GTC	2	6	12084	12089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014378	GT	3	6	12104	12109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014378	G	6	6	12117	12122	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014378	CCT	2	6	12168	12173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014378	GA	3	6	12230	12235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014378	TC	3	6	12241	12246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014378	GC	4	8	12282	12289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014378	GGT	2	6	12307	12312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014378	CCA	2	6	12329	12334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014378	GCCT	2	8	12380	12387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014378	AGG	2	6	12395	12400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014378	CCA	2	6	12425	12430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014378	CA	3	6	12572	12577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014378	ACA	2	6	12710	12715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014378	TAG	2	6	12726	12731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014378	GCGA	2	8	12734	12741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014378	CGT	2	6	12796	12801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014378	ATC	2	6	12856	12861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014378	GAAA	2	8	12900	12907	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014378	AGG	2	6	12965	12970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014378	TAC	2	6	12990	12995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014378	GGGAG	2	10	13047	13056	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014378	TC	3	6	13370	13375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014378	AAC	2	6	13536	13541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014378	CATT	2	8	13632	13639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014378	AGA	2	6	13793	13798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014378	GA	3	6	13797	13802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014378	GCC	2	6	13952	13957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014378	TGA	2	6	14079	14084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014378	CT	3	6	14088	14093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014378	GC	3	6	14199	14204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014378	GA	3	6	14205	14210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014378	CAA	2	6	14282	14287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014378	TGA	3	9	14404	14412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014378	CGG	2	6	14438	14443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014378	CAA	2	6	14532	14537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014378	CAGG	2	8	14768	14775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014378	CGTA	2	8	14849	14856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014378	AG	3	6	14938	14943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014378	TCG	2	6	15047	15052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014378	CTGGAG	2	12	15057	15068	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014378	CGT	2	6	15127	15132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014378	CGT	2	6	15153	15158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014378	GTT	2	6	15230	15235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014378	CAGAG	2	10	15241	15250	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014378	GATAA	2	10	15268	15277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014378	AGA	2	6	15354	15359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014378	AATA	2	8	15484	15491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014378	GAT	2	6	15497	15502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014378	AT	3	6	15501	15506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014378	A	6	6	15521	15526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014378	TAAA	2	8	15535	15542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014378	GGT	2	6	15549	15554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014378	CAG	2	6	15592	15597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014378	TCC	2	6	15603	15608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014378	ATTA	2	8	15663	15670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014378	AT	3	6	15671	15676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014378	TAA	2	6	15699	15704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014378	TAT	2	6	15721	15726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014378	TAA	2	6	15736	15741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014378	ATA	2	6	15748	15753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014378	TAT	2	6	15810	15815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014378	TAGTT	2	10	15822	15831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014378	AAT	2	6	15853	15858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014378	GA	3	6	15866	15871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014378	TAAT	2	8	15872	15879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014378	AG	3	6	15884	15889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014378	AAAGC	2	10	16429	16438	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014378	TTA	2	6	16458	16463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014378	AATT	2	8	16478	16485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014378	TAA	2	6	17491	17496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014378	TTC	2	6	17531	17536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014378	TA	3	6	17578	17583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014378	TTA	2	6	17605	17610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014378	TCT	2	6	17689	17694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014378	CAT	2	6	17710	17715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014378	TCT	2	6	17762	17767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014378	GCT	2	6	17768	17773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014378	AATACT	2	12	17801	17812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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157	NC_014378	TCCT	2	8	17844	17851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_014378	T	7	7	17876	17882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014378	ATA	2	6	17893	17898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014378	TA	3	6	17897	17902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014378	G	7	7	17967	17973	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_014378	TAT	2	6	20910	20915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014378	AGTTT	2	10	20934	20943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014378	AAG	2	6	20988	20993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014378	T	6	6	21006	21011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014378	ACT	2	6	21019	21024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_014378	CCT	2	6	21713	21718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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174	NC_014378	A	6	6	21749	21754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014378	GAG	2	6	21774	21779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_014378	TTA	2	6	21866	21871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014378	T	6	6	21883	21888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_014378	A	6	6	21901	21906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014378	TAA	2	6	21907	21912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014378	A	6	6	21922	21927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014378	ATA	2	6	21955	21960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014378	ATA	2	6	22046	22051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014378	A	7	7	22055	22061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014378	TAT	2	6	22081	22086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014378	TAT	2	6	22208	22213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_014378	TA	4	8	22565	22572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_014378	TAA	2	6	36566	36571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014378	TAAT	2	8	36579	36586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014378	AAT	2	6	36667	36672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_014378	A	7	7	36684	36690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_014378	AT	3	6	36714	36719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_014378	T	6	6	36760	36765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_014378	TAT	2	6	36771	36776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_014378	A	6	6	36810	36815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014378	TAT	2	6	36827	36832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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